MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011988	CGGTGC	2	12	352736	352747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222106415
6002	NC_011988	CTGT	2	8	352818	352825	0 %	50 %	25 %	25 %	222106415
6003	NC_011988	CGC	2	6	352829	352834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106415
6004	NC_011988	GCTG	2	8	352925	352932	0 %	25 %	50 %	25 %	222106415
6005	NC_011988	CGG	2	6	353027	353032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106416
6006	NC_011988	ATG	2	6	353071	353076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106416
6007	NC_011988	GTG	2	6	353157	353162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106416
6008	NC_011988	ATC	2	6	353190	353195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106416
6009	NC_011988	TGA	2	6	353198	353203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106416
6010	NC_011988	CGC	2	6	353250	353255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106416
6011	NC_011988	CTC	2	6	353282	353287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106416
6012	NC_011988	GCC	2	6	353405	353410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106416
6013	NC_011988	GCCAGC	2	12	353449	353460	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222106416
6014	NC_011988	GCATCG	2	12	353461	353472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106416
6015	NC_011988	TGA	2	6	353510	353515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106416
6016	NC_011988	ATG	2	6	353598	353603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106416
6017	NC_011988	GTG	2	6	353625	353630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106416
6018	NC_011988	GAT	2	6	353643	353648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106416
6019	NC_011988	GTG	3	9	353649	353657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106416
6020	NC_011988	TC	3	6	353738	353743	0 %	50 %	0 %	50 %	222106416
6021	NC_011988	GGCGA	2	10	353770	353779	20 %	0 %	60 %	20 %	222106416
6022	NC_011988	CCAC	2	8	353820	353827	25 %	0 %	0 %	75 %	222106416
6023	NC_011988	TGA	2	6	353890	353895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106416
6024	NC_011988	GAA	2	6	353934	353939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106416
6025	NC_011988	CTGGC	2	10	354113	354122	0 %	20 %	40 %	40 %	222106417
6026	NC_011988	AGCG	2	8	354128	354135	25 %	0 %	50 %	25 %	222106417
6027	NC_011988	GAA	2	6	354245	354250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106417
6028	NC_011988	AGC	2	6	354257	354262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106417
6029	NC_011988	GCC	2	6	354263	354268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106417
6030	NC_011988	TCCT	2	8	354278	354285	0 %	50 %	0 %	50 %	222106417
6031	NC_011988	CGA	2	6	354310	354315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106417
6032	NC_011988	TAG	2	6	354357	354362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106417
6033	NC_011988	GTT	2	6	354388	354393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106417
6034	NC_011988	CCG	2	6	354417	354422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106417
6035	NC_011988	CAT	2	6	354433	354438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106417
6036	NC_011988	TGA	3	9	354532	354540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106417
6037	NC_011988	GAT	2	6	354623	354628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106417
6038	NC_011988	GGA	2	6	354721	354726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106417
6039	NC_011988	CCG	2	6	354732	354737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106417
6040	NC_011988	CGAG	2	8	354760	354767	25 %	0 %	50 %	25 %	222106417
6041	NC_011988	GCA	2	6	354772	354777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106417
6042	NC_011988	GAT	2	6	354824	354829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106417
6043	NC_011988	GAG	2	6	354929	354934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106417
6044	NC_011988	GAT	2	6	354997	355002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106417
6045	NC_011988	TGC	2	6	355005	355010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106417
6046	NC_011988	ATT	2	6	355040	355045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106417
6047	NC_011988	CTG	2	6	355285	355290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106418
6048	NC_011988	CCGG	2	8	355295	355302	0 %	0 %	50 %	50 %	222106418
6049	NC_011988	GAG	2	6	355345	355350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106418
6050	NC_011988	GCC	2	6	355361	355366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106418
6051	NC_011988	GGC	3	9	355415	355423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106418
6052	NC_011988	GGC	2	6	355554	355559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106418
6053	NC_011988	TGG	2	6	355601	355606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106418
6054	NC_011988	TGA	2	6	355718	355723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106418
6055	NC_011988	AG	3	6	355893	355898	50 %	0 %	50 %	0 %	222106418
6056	NC_011988	TCGA	2	8	355915	355922	25 %	25 %	25 %	25 %	222106418
6057	NC_011988	CCG	2	6	355925	355930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106418
6058	NC_011988	GCT	2	6	356028	356033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6059	NC_011988	CCG	2	6	356039	356044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106419
6060	NC_011988	ATC	2	6	356197	356202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106419
6061	NC_011988	ACG	2	6	356282	356287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6062	NC_011988	TGT	2	6	356310	356315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106419
6063	NC_011988	CCA	2	6	356318	356323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106419
6064	NC_011988	CGC	2	6	356353	356358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106419
6065	NC_011988	CTG	2	6	356443	356448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6066	NC_011988	CCGGG	2	10	356463	356472	0 %	0 %	60 %	40 %	222106419
6067	NC_011988	GCC	2	6	356491	356496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106419
6068	NC_011988	TCG	2	6	356552	356557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6069	NC_011988	GCA	2	6	356565	356570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6070	NC_011988	TCA	2	6	356624	356629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106419
6071	NC_011988	CCGA	2	8	356719	356726	25 %	0 %	25 %	50 %	222106419
6072	NC_011988	GCC	2	6	356728	356733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106419
6073	NC_011988	ATGT	2	8	356794	356801	25 %	50 %	25 %	0 %	222106419
6074	NC_011988	ATCG	2	8	356878	356885	25 %	25 %	25 %	25 %	222106419
6075	NC_011988	CGA	2	6	357071	357076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6076	NC_011988	GAT	2	6	357084	357089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106419
6077	NC_011988	TGACG	2	10	357126	357135	20 %	20 %	40 %	20 %	222106419
6078	NC_011988	CCA	2	6	357155	357160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106419
6079	NC_011988	GAC	2	6	357174	357179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6080	NC_011988	CCG	2	6	357293	357298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106419
6081	NC_011988	CGA	2	6	357333	357338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6082	NC_011988	ATG	2	6	357359	357364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106419
6083	NC_011988	GAC	2	6	357385	357390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106419
6084	NC_011988	ATC	2	6	357397	357402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106419
6085	NC_011988	TCA	2	6	357411	357416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106419
6086	NC_011988	AAG	2	6	357439	357444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106419
6087	NC_011988	GCT	2	6	357655	357660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106420
6088	NC_011988	T	6	6	357678	357683	0 %	100 %	0 %	0 %	222106420
6089	NC_011988	ACC	2	6	357774	357779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106420
6090	NC_011988	AACC	2	8	357856	357863	50 %	0 %	0 %	50 %	222106420
6091	NC_011988	CAT	2	6	357916	357921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106420
6092	NC_011988	GAT	2	6	357925	357930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106420
6093	NC_011988	AAG	2	6	357977	357982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106420
6094	NC_011988	GTG	2	6	358010	358015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106420
6095	NC_011988	TTC	2	6	358065	358070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106420
6096	NC_011988	CGGCT	2	10	358082	358091	0 %	20 %	40 %	40 %	222106420
6097	NC_011988	TTC	2	6	358118	358123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106420
6098	NC_011988	GCA	2	6	358187	358192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106420
6099	NC_011988	CCGC	2	8	358254	358261	0 %	0 %	25 %	75 %	222106420
6100	NC_011988	CGGTG	2	10	358366	358375	0 %	20 %	60 %	20 %	222106420
6101	NC_011988	TCG	2	6	358419	358424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106420
6102	NC_011988	CGT	2	6	358450	358455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106420
6103	NC_011988	TGA	2	6	358494	358499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106420
6104	NC_011988	TCT	3	9	358522	358530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106420
6105	NC_011988	TGAG	2	8	358565	358572	25 %	25 %	50 %	0 %	222106421
6106	NC_011988	C	6	6	358589	358594	0 %	0 %	0 %	100 %	222106421
6107	NC_011988	CAA	2	6	358626	358631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106421
6108	NC_011988	GTTG	2	8	358638	358645	0 %	50 %	50 %	0 %	222106421
6109	NC_011988	CAT	2	6	358653	358658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106421
6110	NC_011988	TTCT	2	8	358663	358670	0 %	75 %	0 %	25 %	222106421
6111	NC_011988	GGT	2	6	358671	358676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106421
6112	NC_011988	GCT	2	6	358680	358685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106421
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6115	NC_011988	G	6	6	358811	358816	0 %	0 %	100 %	0 %	222106421
6116	NC_011988	CCA	2	6	358859	358864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106421
6117	NC_011988	CGG	2	6	358902	358907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106421
6118	NC_011988	GCC	2	6	358984	358989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106421
6119	NC_011988	GAT	2	6	359016	359021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106421
6120	NC_011988	ATC	2	6	359215	359220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106421
6121	NC_011988	AGCC	2	8	359226	359233	25 %	0 %	25 %	50 %	222106421
6122	NC_011988	CAG	2	6	359254	359259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106421
6123	NC_011988	TCAG	2	8	359309	359316	25 %	25 %	25 %	25 %	222106421
6124	NC_011988	TCG	2	6	359357	359362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106421
6125	NC_011988	TGAC	2	8	359473	359480	25 %	25 %	25 %	25 %	222106422
6126	NC_011988	ACC	2	6	359484	359489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106422
6127	NC_011988	GTT	2	6	359517	359522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106422
6128	NC_011988	CCAC	2	8	359527	359534	25 %	0 %	0 %	75 %	222106422
6129	NC_011988	TGC	2	6	359591	359596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106422
6130	NC_011988	TGC	2	6	359614	359619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106422
6131	NC_011988	TG	3	6	359638	359643	0 %	50 %	50 %	0 %	222106422
6132	NC_011988	GCG	2	6	359650	359655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106422
6133	NC_011988	ACAAGG	2	12	359683	359694	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222106422
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6135	NC_011988	CCA	2	6	359734	359739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106422
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6137	NC_011988	CTG	2	6	359787	359792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106422
6138	NC_011988	GATGCT	2	12	359825	359836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222106422
6139	NC_011988	TAT	2	6	359886	359891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106422
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6144	NC_011988	GC	3	6	360114	360119	0 %	0 %	50 %	50 %	222106422
6145	NC_011988	TCG	2	6	360139	360144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106422
6146	NC_011988	GATC	2	8	360152	360159	25 %	25 %	25 %	25 %	222106422
6147	NC_011988	GTCCA	2	10	360165	360174	20 %	20 %	20 %	40 %	222106422
6148	NC_011988	GATG	2	8	360182	360189	25 %	25 %	50 %	0 %	222106422
6149	NC_011988	CCT	2	6	360344	360349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106422
6150	NC_011988	TAT	2	6	360447	360452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106422
6151	NC_011988	GCA	2	6	360482	360487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106422
6152	NC_011988	GCCGG	2	10	360557	360566	0 %	0 %	60 %	40 %	222106422
6153	NC_011988	TGGC	2	8	360740	360747	0 %	25 %	50 %	25 %	222106422
6154	NC_011988	CAC	2	6	360860	360865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106422
6155	NC_011988	ATCG	2	8	360875	360882	25 %	25 %	25 %	25 %	222106422
6156	NC_011988	GCG	2	6	360925	360930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106422
6157	NC_011988	CAG	2	6	360933	360938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106422
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6159	NC_011988	ATCG	2	8	361002	361009	25 %	25 %	25 %	25 %	222106422
6160	NC_011988	TGG	2	6	361078	361083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106422
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6164	NC_011988	GCGG	2	8	361205	361212	0 %	0 %	75 %	25 %	222106422
6165	NC_011988	GC	3	6	361305	361310	0 %	0 %	50 %	50 %	222106423
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6175	NC_011988	CTG	2	6	361718	361723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106423
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6199	NC_011988	TCG	2	6	362730	362735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106423
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6202	NC_011988	GGT	2	6	362851	362856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106423
6203	NC_011988	TCG	2	6	362901	362906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106423
6204	NC_011988	TGA	2	6	362964	362969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106423
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6232	NC_011988	GCC	2	6	364485	364490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106425
6233	NC_011988	CCG	2	6	364507	364512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106425
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6235	NC_011988	CCG	2	6	364536	364541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106425
6236	NC_011988	CAG	2	6	364581	364586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106425
6237	NC_011988	AGCC	2	8	364589	364596	25 %	0 %	25 %	50 %	222106425
6238	NC_011988	CTG	2	6	364653	364658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106425
6239	NC_011988	GCCAT	2	10	364696	364705	20 %	20 %	20 %	40 %	222106425
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6241	NC_011988	ATCC	2	8	364773	364780	25 %	25 %	0 %	50 %	222106425
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6363	NC_011988	GCA	2	6	370988	370993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106432
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6469	NC_011988	CAT	2	6	376263	376268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106435
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6482	NC_011988	TGG	2	6	376968	376973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106436
6483	NC_011988	GGC	2	6	377036	377041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106436
6484	NC_011988	CCAT	2	8	377062	377069	25 %	25 %	0 %	50 %	222106436
6485	NC_011988	ATTGC	2	10	377095	377104	20 %	40 %	20 %	20 %	222106436
6486	NC_011988	TCCT	2	8	377166	377173	0 %	50 %	0 %	50 %	222106436
6487	NC_011988	GCC	2	6	377189	377194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106436
6488	NC_011988	TGG	2	6	377215	377220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106436
6489	NC_011988	TGG	2	6	377250	377255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106436
6490	NC_011988	CTG	2	6	377307	377312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106436
6491	NC_011988	TG	4	8	377370	377377	0 %	50 %	50 %	0 %	222106437
6492	NC_011988	GTT	2	6	377581	377586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106437
6493	NC_011988	CAA	2	6	377608	377613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106437
6494	NC_011988	CAT	3	9	377635	377643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106437
6495	NC_011988	TCC	2	6	377657	377662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106437
6496	NC_011988	CGA	2	6	377905	377910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106437
6497	NC_011988	GGCAC	2	10	377915	377924	20 %	0 %	40 %	40 %	222106437
6498	NC_011988	GCT	2	6	377992	377997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106437
6499	NC_011988	GAT	2	6	377998	378003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106437
6500	NC_011988	GCA	2	6	378055	378060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106437

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